Óriási rejtett DNS-t találtak a szájban
A Tokiói Egyetem kutatói és más szakemberek meglepő felfedezést tettek az emberek szájában rejtőző Inocles nevű óriási DNS-elemekről, közli a Magyar Hírlap.
Ezek az elemek központi szerepet játszanak abban, hogy a baktériumok alkalmazkodni tudjanak a száj folyamatosan változó környezetéhez. A kutatás új betekintést nyújt abba, hogyan telepednek meg és maradnak fenn az emberi szájban élő baktériumok, ami fontos lehet az egészség, betegségek és a mikrobiom-kutatás szempontjából, írta a Sience Daily nyomán a lap.
Yuya Kiguchi, a Tokiói Egyetem Graduate School of Frontier Sciences Yutaka Suzuki Laboratóriumának kutatója és csapata a talajmikrobiom külső DNS-ében történt felfedezések inspirációjára alapozva az emberi nyálminták nagy halmazát kezdte vizsgálni, hogy hasonló elemekre bukkanjon az emberi nyálban.
„Tudjuk, hogy az orális mikrobiomban rengetegféle baktérium él, de sok funkciójuk és működési módjuk még ismeretlen,” mondta Kiguchi. „Kutatásaink során felfedeztük az Inoclest, egy extrakromoszomális DNS példáját – olyan DNS-darabokat, amelyek a sejtekben, jelen esetben baktériumokban vannak, de nem a fő DNS-en belül. Olyan, mintha egy könyvhöz plusz lábjegyzeteket találnánk, amiket most kezdünk el olvasni, hogy megtudjuk, mit csinálnak.”
Az Inocles kimutatása nem volt egyszerű, mivel a hagyományos DNS-szekvenálási módszerek a genetikai adatokat darabokra törik, így lehetetlen nagyobb elemek rekonstruálása. Ennek leküzdésére a kutatócsapat fejlett, hosszú olvasású szekvenálási technikákat alkalmazott, amelyek hosszabb DNS-szakaszokat képesek rögzíteni. Egy kulcsfontosságú áttörést Nagisa Hamamoto, a társszerző fejlesztett elő, aki kidolgozta a preNuc nevű módszert, mely szelektíven eltávolítja az emberi DNS-t a nyálmintákból, jelentősen javítva a hosszabb DNS-szakaszok szekvenálásának minőségét. Ennek köszönhetően sikerült először teljes Inocles genomokat összeállítani, amelyek kiderült, hogy a Streptococcus salivarius baktériumokban találhatók, bár maga a gazdaszervezet azonosítása is nehézségekbe ütközött.
A csapat célja, hogy stabil módszereket dolgozzon ki Inoclest tartalmazó baktériumok tenyésztésére. Ez lehetővé teszi majd, hogy megvizsgálják, hogyan működnek az Inocles, képesek-e terjedni emberek között, és milyen hatással lehetnek a száj egészségére, például a fogszuvasodásra vagy a fogágybetegségre.
