A képalkotó módszerek egy részét (PET, fMRI) elterjedten használják annak vizsgálatára, hogy bizonyos állapotokban, egyes tevékenységek kapcsán mely agyterületek aktivizálódnak. A kapott adatokból messzemenő következtetéseket vonnak le – meghatározzák, hogy milyen agyi régiók játszanak szerepet bizonyos funkciókban. Alapvető kérdés azonban, hogy egyértelműek-e az ezekkel a módszerekkel készült agytérképek.